Структура на протеина
Предсказвания с ESMFold · достоверност на предсказването · функционални места за свързване
Покритие на протеиновите структури
| Вид | PDB (ESMFold) | Анотация на местата за свързване |
|---|---|---|
| Cucumber | 23,736 | GPSite (23,730 гена) |
| Watermelon | 14,901 | — |
| Melon | 27,757 | GPSite (27,757 гена) |
| Pumpkin (C. moschata) | 29,898 | GPSite (29,898 гена) |
| Pumpkin (C. pepo) | 26,813 | GPSite (26,813 гена) |
| BitterGourd | 39,839 | GPSite (39,839 гена) |
| BottleGourd | 21,629 | GPSite (21,629 гена) |
| WaxGourd | 26,897 | GPSite (26,897 гена) |
| SpongeGourd | 30,846 | GPSite (30,846 гена) |
Какво получавате за всеки протеин
| 3D структура | Интерактивно ESMFold предсказване, визуализирано с MolStar (въртене / мащабиране / ниво на остатъци) | |
| Достоверност на предсказването | Оценка за всеки остатък: отлично (>90) / добре (70-90) / средно (50-70) / ниско (<50) | |
| Места за свързване (GPSite) | Функционални места, предсказани от ИИ: ДНК / РНК / пептид / протеин / ATP / ZN / CA / MG / MN | |
| Анотации на остатъците | Аминокиселина за всеки остатък + тип място + оценка на достоверност (при наличие на GPSite JSON) | |
| Изтегляне на PDB | Целият PDB файл за офлайн анализ (PyMOL / ChimeraX / Rosetta) |
ИИ резюме
- Първо предскажете структура — след това генерирайте кратка интерпретация на резултата
- Обхваща качеството pLDDT, функционалните подсказки за местата на свързване и практична следваща стъпка
- След резюмето можете да задавате допълнителни въпроси за този протеин
💡 Опитайте тези ID на гени: (Cucumber) · (Melon) · (Watermelon) · (C. pepo) · (C. moschata)