Δομή πρωτεΐνης

Προβλέψεις ESMFold · αξιοπιστία πρόβλεψης · λειτουργικές θέσεις σύνδεσης

Κάλυψη δομών πρωτεϊνών

ΕίδοςPDB ESMFoldΣχολιασμός θέσεων σύνδεσης
Cucumber23,736GPSite (23,730 γονίδια)
Watermelon14,901—
Melon27,757GPSite (27,757 γονίδια)
Pumpkin (C. moschata)29,898GPSite (29,898 γονίδια)
Pumpkin (C. pepo)26,813GPSite (26,813 γονίδια)
BitterGourd39,839GPSite (39,839 γονίδια)
BottleGourd21,629GPSite (21,629 γονίδια)
WaxGourd26,897GPSite (26,897 γονίδια)
SpongeGourd30,846GPSite (30,846 γονίδια)

Τι λαμβάνετε ανά πρωτεΐνη

Τρισδιάστατη δομήΔιαδραστική πρόβλεψη ESMFold με απεικόνιση σε MolStar (περιστροφή / εστίαση / επίπεδο υπολειμμάτων)
Αξιοπιστία πρόβλεψηςΒαθμολογία αξιοπιστίας ανά υπόλειμμα: Εξαιρετική (>90) / Καλή (70-90) / Μέτρια (50-70) / Χαμηλή (<50)
Θέσεις σύνδεσης (GPSite)Προβλεπόμενες από ΤΝ λειτουργικές θέσεις: DNA / RNA / Peptide / Protein / ATP / ZN / CA / MG / MN
Σχολιασμοί υπολειμμάτωνΑμινοξύ ανά υπόλειμμα + τύπος θέσης + βαθμολογία αξιοπιστίας (όταν το JSON του GPSite είναι διαθέσιμο)
Λήψη PDBΛήψη πλήρους αρχείου PDB για ανάλυση εκτός σύνδεσης (PyMOL / ChimeraX / Rosetta)

Σύνοψη ΤΝ

  • Προβλέψτε πρώτα μια δομή — στη συνέχεια δημιουργήστε μια σύντομη ερμηνεία του αποτελέσματος
  • Καλύπτει την ποιότητα pLDDT, λειτουργικές ενδείξεις από θέσεις σύνδεσης και ένα πρακτικό επόμενο βήμα
  • Κάντε ερωτήσεις παρακολούθησης για την πρωτεΐνη μετά τη σύνοψη
💡 Δοκιμάστε αυτά τα ID γονιδίων: (Cucumber) · (Melon) · (Watermelon) · (C. pepo) · (C. moschata)