Istruktura ng Protina

Mga prediksyon ng ESMFold · Kumpiyansa ng prediksyon · mga functional binding site

Saklaw ng estruktura ng protina

SpeciesMga PDB ng ESMFoldAnotasyon ng binding site
Cucumber23,736GPSite (23,730 gen)
Watermelon14,901—
Melon27,757GPSite (27,757 gen)
Pumpkin (C. moschata)29,898GPSite (29,898 gen)
Pumpkin (C. pepo)26,813GPSite (26,813 gen)
BitterGourd39,839GPSite (39,839 gen)
BottleGourd21,629GPSite (21,629 gen)
WaxGourd26,897GPSite (26,897 gen)
SpongeGourd30,846GPSite (30,846 gen)

Ang makukuha mo kada protina

Istrukturang 3DInteraktibong prediksyon ng ESMFold na ipinapakita gamit ang MolStar (ikot / zoom / antas ng residue)
Kumpiyansa ng PrediksyonSkor ng kumpiyansa kada residue: Magaling (>90) / Mabuti (70-90) / Katamtaman (50-70) / Mababa (<50)
Mga Binding Site (GPSite)Mga functional site na hinulaan ng AI: DNA / RNA / Peptide / Protina / ATP / ZN / CA / MG / MN
Mga Anotasyon ng ResidueAmino acid kada residue + uri ng site + skor ng kumpiyansa (kapag available ang GPSite JSON)
Pag-download ng PDBBuong pag-download ng PDB file para sa offline na pagsusuri (PyMOL / ChimeraX / Rosetta)

Buod ng AI

  • Hulaan muna ang estruktura — pagkatapos ay bumuo ng maikling interpretasyon ng resulta
  • Saklaw ang kalidad ng pLDDT, mga pahiwatig ng tungkulin ng binding site, at isang praktikal na susunod na hakbang
  • Magtanong pa tungkol sa protinang ito pagkatapos ng buod
💡 Sumubok ng mga Gene ID na ito: (Cucumber) · (Melon) · (Watermelon) · (C. pepo) · (C. moschata)