Ақуыз құрылымы

ESMFold болжамдары · Болжам сенімділігі · Функционалдық байланысу орындары

Ақуыз құрылымдарының қамтуы

ТүрPDB (ESMFold)Байланысу орнының аннотациясы
Cucumber23,736GPSite (23,730 ген)
Watermelon14,901—
Melon27,757GPSite (27,757 ген)
Pumpkin (C. moschata)29,898GPSite (29,898 ген)
Pumpkin (C. pepo)26,813GPSite (26,813 ген)
BitterGourd39,839GPSite (39,839 ген)
BottleGourd21,629GPSite (21,629 ген)
WaxGourd26,897GPSite (26,897 ген)
SpongeGourd30,846GPSite (30,846 ген)

Әр ақуыз бойынша алатын нәрселеріңіз

3D құрылымMolStar көмегімен көрсетілген интерактивті ESMFold болжамы (бұру / үлкейту / қалдық деңгейі)
Болжамның сенімділігіӘр қалдық бойынша сенімділік баллы: Өте жақсы (>90) / Жақсы (70-90) / Орташа (50-70) / Төмен (<50)
Байланысу орындары (GPSite)ЖИ болжаған функционалдық орындар: ДНҚ / РНҚ / пептид / ақуыз / ATP / ZN / CA / MG / MN
Қалдықтардың аннотацияларыӘр қалдық үшін аминқышқылы + орын түрі + сенімділік баллы (GPSite JSON болған жағдайда)
PDB жүктеуОфлайн талдау үшін толық PDB файлы (PyMOL / ChimeraX / Rosetta)

ЖИ қорытындысы

  • Алдымен құрылымды болжаңыз — содан кейін нәтиженің қысқаша интерпретациясын алыңыз
  • pLDDT сапасын, байланысу орындарының функциялық тұспалдарын және практикалық келесі қадамды қамтиды
  • Қорытындыдан кейін бұл ақуыз туралы қосымша сұрақтар қоя аласыз
💡 Мына ген ID-лерін сынап көріңіз: (Cucumber) · (Melon) · (Watermelon) · (C. pepo) · (C. moschata)