Ақуыз құрылымы
ESMFold болжамдары · Болжам сенімділігі · Функционалдық байланысу орындары
Ақуыз құрылымдарының қамтуы
| Түр | PDB (ESMFold) | Байланысу орнының аннотациясы |
|---|---|---|
| Cucumber | 23,736 | GPSite (23,730 ген) |
| Watermelon | 14,901 | — |
| Melon | 27,757 | GPSite (27,757 ген) |
| Pumpkin (C. moschata) | 29,898 | GPSite (29,898 ген) |
| Pumpkin (C. pepo) | 26,813 | GPSite (26,813 ген) |
| BitterGourd | 39,839 | GPSite (39,839 ген) |
| BottleGourd | 21,629 | GPSite (21,629 ген) |
| WaxGourd | 26,897 | GPSite (26,897 ген) |
| SpongeGourd | 30,846 | GPSite (30,846 ген) |
Әр ақуыз бойынша алатын нәрселеріңіз
| 3D құрылым | MolStar көмегімен көрсетілген интерактивті ESMFold болжамы (бұру / үлкейту / қалдық деңгейі) | |
| Болжамның сенімділігі | Әр қалдық бойынша сенімділік баллы: Өте жақсы (>90) / Жақсы (70-90) / Орташа (50-70) / Төмен (<50) | |
| Байланысу орындары (GPSite) | ЖИ болжаған функционалдық орындар: ДНҚ / РНҚ / пептид / ақуыз / ATP / ZN / CA / MG / MN | |
| Қалдықтардың аннотациялары | Әр қалдық үшін аминқышқылы + орын түрі + сенімділік баллы (GPSite JSON болған жағдайда) | |
| PDB жүктеу | Офлайн талдау үшін толық PDB файлы (PyMOL / ChimeraX / Rosetta) |
ЖИ қорытындысы
- Алдымен құрылымды болжаңыз — содан кейін нәтиженің қысқаша интерпретациясын алыңыз
- pLDDT сапасын, байланысу орындарының функциялық тұспалдарын және практикалық келесі қадамды қамтиды
- Қорытындыдан кейін бұл ақуыз туралы қосымша сұрақтар қоя аласыз
💡 Мына ген ID-лерін сынап көріңіз: (Cucumber) · (Melon) · (Watermelon) · (C. pepo) · (C. moschata)