Bine ați venit la CucurbitAgent

Platformă de nouă generație pentru cercetarea Cucurbitaceae, care combină modele lingvistice de mari dimensiuni și date multi-omice.

Cucurbit

Despre CucurbitAgent

Cucurbitaceele —pepenele verde, castravetele, pepenele galben, dovleacul, castravetele amar și culturile înrudite— sunt culturi importante în întreaga lume. Seturile de date genomice și cercetarea publicată oferă informații valoroase pentru înțelegerea funcției genelor și îmbunătățirea caracterelor culturilor. Aceste resurse sunt însă distribuite între baze de date și formate diferite, iar identificatorii genilor pot diferi între versiunile genomelor. Cercetătorii trebuie adesea să consulte mai multe surse pentru a conecta o genă cu tiparele sale de expresie, variantele genetice, structura proteică prezisă și constatările publicate.

Dezvoltat de Beijing Vegetable Research Center (BVRC) din cadrul Beijing Academy of Agriculture and Forestry Sciences (BAAFS), CucurbitAgent aduce laolaltă resurse multi-omice de la nouă specii cultivate de cucurbitacee. Platforma integrează adnotări de gene și homologi candidați, corespondențele identificatorilor de gene între versiuni, variante genetice naturale, profiluri de expresie tisulară și relații de co-exprimare, structuri proteice prezise de ESMFold, situsuri de legare prezise de GPSite și un corpus de literatură curat.

Utilizatorii pot explora aceste resurse punând întrebări în limbaj natural. Un agent AI conversațional selectează instrumentele relevante, preia informațiile din bazele de date subiacente și integrează rezultatele în răspunsuri legate de înregistrările sursă. Cercetătorii pot, de asemenea, căuta direct în modulele Gen, Expresie, Proteină și Literatură și descărca resursele genomice disponibile.

Prin conectarea acestor surse complementare de dovezi, CucurbitAgent ajută cercetătorii să investigheze gene candidat, să interpreteze tipare de expresie, să examineze variantele în contextul lor de secvență și structură și să formuleze ipoteze pentru studii funcționale și ameliorarea culturilor.

Literatură Recentă

(2026-11-02)
Superior Therapeutic Efficacy and Reduced Systemic Toxicity of a Cucurbit[7]uril-Camptothecin Supramolecular Complex in Colorectal Cancer.
Molecular pharmaceutics | 2026 Nov 2

The clinical application of camptothecin (CPT) is limited by poor solubility and severe toxicity. This study compares the therapeutic performance of a cucurbit[7]uril-based CPT complex (CB[7]-CPT) with free CPT and β-cyclodextrin-CPT (β-CD-CPT) in colorectal cancer models. In vitro, free CPT, β-CD-CPT, and CB[7]-CPT were tested on normal LO2 and cancerous HCT116 cells. CB[7] encapsulation reduced toxicity toward normal LO2 cells (IC50: 0.47 μM, ∼25-fold higher than the IC50 of free CPT) while improving potency against HCT116 cells (CB[7]-CPT IC50: 0.24 μM; free CPT IC50: 0.55 μM, ∼2-fold more potent than free CPT). The selectivity index improved from 0.034 (CPT) to 1.976 (CB[7]-CPT), indicating a wide safety margin. Apoptosis assays confirmed that CB[7]-CPT induced significantly greater apoptotic cell death at equivalent concentrations than either free CPT or β-CD-CPT. In HCT116 xenograft models, CB[7]-CPT achieved a tumor inhibition rate of 76%, markedly outperforming free CPT (46%) and β-CD-CPT (62%). This enhanced efficacy was accompanied by increased intratumoral apoptosis, reduced proliferation, and decreased microvessel density. Importantly, CB[7]-CPT markedly attenuated liver, kidney, and gastrointestinal toxicity typically associated with CPT exposure. Pharmacokinetically, CB[7]-CPT displayed a 1.94-fold higher AUC and a 1.59-fold prolonged elimination half-life relative to free CPT, reflecting extended circulation and improved systemic exposure. These findings collectively establish CB[7]-CPT as a highly effective and safer alternative not only to free CPT but also to conventional cyclodextrin-based formulations, demonstrating enhanced selectivity, robust pro-apoptotic activity, and a superior safety profile.

Effects of LD20 exposure to insecticides on the reproductive fitness of Zeugodacus cucurbitae (Diptera: Tephritidae).
Journal of economic entomology | 2026 Nov 2

The melon fly, Zeugodacus cucurbitae (Coquillett), is a major pest of cucurbitaceous fruits, and insecticides are widely used for its management. However, sometimes environmental factors may reduce insecticide deposits below lethal levels, and adult flies may receive only partial exposure during spraying, resulting in exposure to non-lethal doses. This study evaluated the reproductive fitness of Z. cucurbitae survivors following LD20 exposure to commercially available formulations of fipronil, spinosad, and malathion. Adult flies surviving topical LD20 treatment were assigned to 4 treatment combinations: (1) treated female and treated male (F+M+), (2) treated female and untreated male (F+M-), (3) untreated female and treated male (F-M+), and (4) untreated female and untreated male (F-M-). Malathion (0.18 μg/fly) exerted the most pronounced effects on Z. cucurbitae, significantly reducing mating frequency, progeny production, and adult longevity of treated flies, while increasing the proportion of malformed offspring. In contrast, fipronil (0.04 μg/fly) and spinosad (0.005 μg/fly) exhibited significant effects only when both sexes were treated. Notably, LD20 treatment with malathion enhanced the mating competitiveness of treated female flies, indicating a potential stimulatory effect. The findings suggest that LD20 of malathion had a significant impact on the reproductive fitness of melon flies, even when only 1 of the sexes was treated. In contrast, spinosad and fipronil produced adverse effects only when both sexes were treated, with minimal effects observed when only 1 sex was treated.

De novo creation of solid-placenta, few-seeded melon via targeted mutation of CmSLM/CmAGL11
Molecular Horticulture | 2026-11-01

🔗 Resurse externe

Citare

Dacă platforma v-a fost utilă în cercetare, vă rugăm să citați:

CucurbitAgent: An AI agent for exploring cucurbit multi-omics resources. Rong Zhang, Jian Zhang, Yuming Zhang, et al. bioRxiv 2026.10.09.758138; doi: https://doi.org/10.64898/2026.10.09.758138