Proteinstruktur
ESMFold-prediktioner · prediktionskonfidens · funktionella bindningsställen
Täckning av proteinstrukturer
| Art | ESMFold-PDB:er | Bindningsställesannotering |
|---|---|---|
| Cucumber | 23,736 | GPSite (23,730 gener) |
| Watermelon | 14,901 | — |
| Melon | 27,757 | GPSite (27,757 gener) |
| Pumpkin (C. moschata) | 29,898 | GPSite (29,898 gener) |
| Pumpkin (C. pepo) | 26,813 | GPSite (26,813 gener) |
| BitterGourd | 39,839 | GPSite (39,839 gener) |
| BottleGourd | 21,629 | GPSite (21,629 gener) |
| WaxGourd | 26,897 | GPSite (26,897 gener) |
| SpongeGourd | 30,846 | GPSite (30,846 gener) |
Vad du får för varje protein
| 3D-struktur | Interaktiv ESMFold-prediktion renderad med MolStar (rotera / zooma / restnivå) | |
| Prediktionskonfidens | Konfidenspoäng per rest: Utmärkt (>90) / Bra (70-90) / Godtagbart (50-70) / Låg (<50) | |
| Bindningsställen (GPSite) | AI-predikterade funktionella ställen: DNA / RNA / Peptide / Protein / ATP / ZN / CA / MG / MN | |
| Restannoteringar | Aminosyra per rest + ställetyp + konfidenspoäng (när GPSite-JSON finns tillgänglig) | |
| PDB-nedladdning | Nedladdning av komplett PDB-fil för offlineanalys (PyMOL / ChimeraX / Rosetta) |
AI-sammanfattning
- Prediktera först en struktur — generera sedan en kort tolkning av resultatet
- Täcker pLDDT-kvalitet, funktionella ledtrådar från bindningsställen och ett praktiskt nästa steg
- Ställ följdfrågor om proteinet efter sammanfattningen
💡 Prova dessa gen-ID:n: (Cucumber) · (Melon) · (Watermelon) · (C. pepo) · (C. moschata)