སྤྲི་དཀར་གྲུབ་ཚུལ།
ESMFold སྔོན་དཔག · སྔོན་དཔག་ཡིད་རྟོན་ཚད · བྱེད་ནུས་སྦྲེལ་གནས (Binding site)
སྤྲི་དཀར་གྲུབ་ཚུལ་ཁྱབ་ཚད།
| རིགས། | ESMFold PDB | སྦྲེལ་གནས་མཆན་འགྲེལ། |
|---|---|---|
| Cucumber | 23,736 | GPSite (རྒྱུད་རྒྱུ 23,730) |
| Watermelon | 14,901 | — |
| Melon | 27,757 | GPSite (རྒྱུད་རྒྱུ 27,757) |
| Pumpkin (C. moschata) | 29,898 | GPSite (རྒྱུད་རྒྱུ 29,898) |
| Pumpkin (C. pepo) | 26,813 | GPSite (རྒྱུད་རྒྱུ 26,813) |
| BitterGourd | 39,839 | GPSite (རྒྱུད་རྒྱུ 39,839) |
| BottleGourd | 21,629 | GPSite (རྒྱུད་རྒྱུ 21,629) |
| WaxGourd | 26,897 | GPSite (རྒྱུད་རྒྱུ 26,897) |
| SpongeGourd | 30,846 | GPSite (རྒྱུད་རྒྱུ 30,846) |
སྤྲི་དཀར་རེ་རེ་ནས་ཐོབ་རུང་བ་དག
| 3D གྲུབ་ཚུལ། | MolStar ནང་མངོན་པའི་འགུལ་སྐྱོད་ཀྱི་ ESMFold སྔོན་དཔག (སྐོར་བ / ཆེ་ཆུང / residue རིམ་པ) | |
| སྔོན་དཔག་ཡིད་རྟོན་ཚད། | residue རེ་རེའི་སྐར་གྲངས། ཕུལ་བྱུང (>90) / ལེགས (70-90) / འབྲིང (50-70) / དམན (<50) | |
| སྦྲེལ་གནས (GPSite) | རིག་ནུས་ཀྱི་སྔོན་དཔག་བྱེད་ནུས་གནས། DNA / RNA / Peptide / སྤྲི་དཀར / ATP / ZN / CA / MG / MN | |
| Residue མཆན་འགྲེལ། | residue རེ་རེའི་ amino acid + གནས་ཀྱི་རིགས + ཡིད་རྟོན་ཚད་སྐར་གྲངས (GPSite JSON ཡོད་ན) | |
| PDB ཕབ་ལེན། | དྲ་མེད་དབྱེ་ཞིབ་ཀྱི་ཆེད་དུ་ PDB ཡིག་ཆ་ཆ་ཚང་ཕབ་ལེན (PyMOL / ChimeraX / Rosetta) |
རིག་ནུས་མདོར་བསྡུས།
- ཐོག་མར་གྲུབ་ཚུལ་སྔོན་དཔག་གནང་རོགས — དེ་ནས་མཇུག་འབྲས་ཀྱི་འགྲེལ་བཤད་ཐུང་ངུ་ཞིག་བཟོ་ཆོག
- pLDDT སྤུས་ཚད་དང་། སྦྲེལ་གནས་ཀྱི་བྱེད་ནུས་བརྡ་སྟོན། དེ་བཞིན་ལག་ལེན་གྱི་གོམ་སྟབས་རྗེས་མ་བཅས་འདུས།
- མདོར་བསྡུས་རྗེས་སུ་སྤྲི་དཀར་འདི་སྐོར་གྱི་འདྲི་བ་མུ་མཐུད་ཆོག
💡 རྒྱུད་རྒྱུ ID འདི་དག་ཚོད་ལྟ་གནང་རོགས: (Cucumber) · (Melon) · (Watermelon) · (C. pepo) · (C. moschata)