Структура білка

Прогнози ESMFold · достовірність прогнозу · функціональні сайти зв’язування

Покриття структурами білка

ВидPDB (ESMFold)Анотація сайтів зв’язування
Cucumber23,736GPSite (23,730 генів)
Watermelon14,901—
Melon27,757GPSite (27,757 генів)
Pumpkin (C. moschata)29,898GPSite (29,898 генів)
Pumpkin (C. pepo)26,813GPSite (26,813 генів)
BitterGourd39,839GPSite (39,839 генів)
BottleGourd21,629GPSite (21,629 генів)
WaxGourd26,897GPSite (26,897 генів)
SpongeGourd30,846GPSite (30,846 генів)

Що ви отримуєте для білка

3D-структураІнтерактивний прогноз ESMFold у MolStar (обертання / масштабування / рівень залишків)
Достовірність прогнозуОцінка для кожного залишку: відмінно (>90) / добре (70-90) / задовільно (50-70) / низько (<50)
Сайти зв’язування (GPSite)Прогнозовані ШІ функціональні сайти: ДНК / РНК / пептид / білок / ATP / ZN / CA / MG / MN
Анотації залишківАмінокислота + тип сайту + оцінка достовірності для кожного залишку (якщо доступний GPSite JSON)
Завантаження PDBПовний PDB-файл для офлайн-аналізу (PyMOL / ChimeraX / Rosetta)

Підсумок від ШІ

  • Спочатку отримайте структуру — потім стислу інтерпретацію результату
  • Охоплює якість pLDDT, функціональні підказки щодо сайтів зв’язування та практичний наступний крок
  • Після підсумку можна ставити уточнюючі запитання про цей білок
💡 Спробуйте ці ID генів: (Cucumber) · (Melon) · (Watermelon) · (C. pepo) · (C. moschata)