Chào mừng đến với CucurbitAgent

Nền tảng thông minh thế hệ mới cho nghiên cứu Cucurbitaceae, tích hợp các mô hình ngôn ngữ lớn với dữ liệu multi-omics.

Cucurbit

Về CucurbitAgent

Các loại cây thuộc họ bầu bí —dưa hấu, dưa leo, dưa lưới, bí đỏ, khổ qua và các cây trồng có liên quan— là những cây trồng quan trọng trên toàn thế giới. Các bộ dữ liệu bộ gen và nghiên cứu đã công bố cung cấp thông tin quý giá để hiểu chức năng gen và cải thiện tính trạng cây trồng. Tuy nhiên, các tài nguyên này lại phân tán giữa nhiều cơ sở dữ liệu và định dạng, và định danh gen có thể khác nhau giữa các phiên bản bộ gen. Nhà nghiên cứu thường phải tham khảo nhiều nguồn để kết nối một gen với các mô hình biểu hiện, biến thể di truyền, cấu trúc protein dự đoán và các phát hiện đã công bố của nó.

Được phát triển bởi Trung tâm Nghiên cứu Rau Beijing (BVRC) thuộc Viện Khoa học Nông nghiệp và Lâm nghiệp Beijing (BAAFS), CucurbitAgent tập hợp các tài nguyên đa omics từ chín loài bầu bí được trồng trọt. Nền tảng tích hợp chú thích gen và các homolog ứng cử, ánh xạ ID gen giữa các phiên bản, biến thể di truyền tự nhiên, hồ sơ biểu hiện mô và quan hệ đồng biểu hiện, cấu trúc protein dự đoán bằng ESMFold, vị trí liên kết dự đoán bằng GPSite, cùng một kho văn bản được tuyển chọn.

Người dùng có thể khám phá các tài nguyên này bằng cách đặt câu hỏi bằng ngôn ngữ tự nhiên. Một trợ lý AI hội thoại chọn các công cụ phù hợp, truy xuất thông tin từ các cơ sở dữ liệu nền tảng và tích hợp kết quả thành các câu trả lời được liên kết với bản ghi nguồn. Nhà nghiên cứu cũng có thể tìm kiếm trực tiếp trong các mô-đun Gen, Biểu hiện, Protein và Tài liệu, đồng thời tải xuống các tài nguyên bộ gen có sẵn.

Bằng cách kết nối các nguồn bằng chứng bổ trợ này, CucurbitAgent giúp nhà nghiên cứu khảo sát các gen ứng cử, diễn giải các mô hình biểu hiện, xem xét các biến thể trong bối cảnh trình tự và cấu trúc của chúng, đồng thời xây dựng giả thuyết cho các nghiên cứu chức năng và cải thiện cây trồng.

Tài liệu Mới nhất

(2026-11-02)
Superior Therapeutic Efficacy and Reduced Systemic Toxicity of a Cucurbit[7]uril-Camptothecin Supramolecular Complex in Colorectal Cancer.
Molecular pharmaceutics | 2026 Nov 2

The clinical application of camptothecin (CPT) is limited by poor solubility and severe toxicity. This study compares the therapeutic performance of a cucurbit[7]uril-based CPT complex (CB[7]-CPT) with free CPT and β-cyclodextrin-CPT (β-CD-CPT) in colorectal cancer models. In vitro, free CPT, β-CD-CPT, and CB[7]-CPT were tested on normal LO2 and cancerous HCT116 cells. CB[7] encapsulation reduced toxicity toward normal LO2 cells (IC50: 0.47 μM, ∼25-fold higher than the IC50 of free CPT) while improving potency against HCT116 cells (CB[7]-CPT IC50: 0.24 μM; free CPT IC50: 0.55 μM, ∼2-fold more potent than free CPT). The selectivity index improved from 0.034 (CPT) to 1.976 (CB[7]-CPT), indicating a wide safety margin. Apoptosis assays confirmed that CB[7]-CPT induced significantly greater apoptotic cell death at equivalent concentrations than either free CPT or β-CD-CPT. In HCT116 xenograft models, CB[7]-CPT achieved a tumor inhibition rate of 76%, markedly outperforming free CPT (46%) and β-CD-CPT (62%). This enhanced efficacy was accompanied by increased intratumoral apoptosis, reduced proliferation, and decreased microvessel density. Importantly, CB[7]-CPT markedly attenuated liver, kidney, and gastrointestinal toxicity typically associated with CPT exposure. Pharmacokinetically, CB[7]-CPT displayed a 1.94-fold higher AUC and a 1.59-fold prolonged elimination half-life relative to free CPT, reflecting extended circulation and improved systemic exposure. These findings collectively establish CB[7]-CPT as a highly effective and safer alternative not only to free CPT but also to conventional cyclodextrin-based formulations, demonstrating enhanced selectivity, robust pro-apoptotic activity, and a superior safety profile.

Effects of LD20 exposure to insecticides on the reproductive fitness of Zeugodacus cucurbitae (Diptera: Tephritidae).
Journal of economic entomology | 2026 Nov 2

The melon fly, Zeugodacus cucurbitae (Coquillett), is a major pest of cucurbitaceous fruits, and insecticides are widely used for its management. However, sometimes environmental factors may reduce insecticide deposits below lethal levels, and adult flies may receive only partial exposure during spraying, resulting in exposure to non-lethal doses. This study evaluated the reproductive fitness of Z. cucurbitae survivors following LD20 exposure to commercially available formulations of fipronil, spinosad, and malathion. Adult flies surviving topical LD20 treatment were assigned to 4 treatment combinations: (1) treated female and treated male (F+M+), (2) treated female and untreated male (F+M-), (3) untreated female and treated male (F-M+), and (4) untreated female and untreated male (F-M-). Malathion (0.18 μg/fly) exerted the most pronounced effects on Z. cucurbitae, significantly reducing mating frequency, progeny production, and adult longevity of treated flies, while increasing the proportion of malformed offspring. In contrast, fipronil (0.04 μg/fly) and spinosad (0.005 μg/fly) exhibited significant effects only when both sexes were treated. Notably, LD20 treatment with malathion enhanced the mating competitiveness of treated female flies, indicating a potential stimulatory effect. The findings suggest that LD20 of malathion had a significant impact on the reproductive fitness of melon flies, even when only 1 of the sexes was treated. In contrast, spinosad and fipronil produced adverse effects only when both sexes were treated, with minimal effects observed when only 1 sex was treated.

De novo creation of solid-placenta, few-seeded melon via targeted mutation of CmSLM/CmAGL11
Molecular Horticulture | 2026-11-01

🔗 Nguồn lực Bên ngoài

Trích dẫn

Nếu bạn thấy nền tảng này hữu ích cho nghiên cứu của mình, vui lòng trích dẫn:

CucurbitAgent: An AI agent for exploring cucurbit multi-omics resources. Rong Zhang, Jian Zhang, Yuming Zhang, et al. bioRxiv 2026.10.09.758138; doi: https://doi.org/10.64898/2026.10.09.758138