Struktura proteinů
Predikce ESMFold · spolehlivost predikce · funkční vazebná místa
Pokrytí proteinových struktur
| Druh | PDB z ESMFold | Anotace vazebných míst |
|---|---|---|
| Cucumber | 23,736 | GPSite (23,730 genů) |
| Watermelon | 14,901 | — |
| Melon | 27,757 | GPSite (27,757 genů) |
| Pumpkin (C. moschata) | 29,898 | GPSite (29,898 genů) |
| Pumpkin (C. pepo) | 26,813 | GPSite (26,813 genů) |
| BitterGourd | 39,839 | GPSite (39,839 genů) |
| BottleGourd | 21,629 | GPSite (21,629 genů) |
| WaxGourd | 26,897 | GPSite (26,897 genů) |
| SpongeGourd | 30,846 | GPSite (30,846 genů) |
Co získáte u každého proteinu
| 3D struktura | Interaktivní predikce ESMFold zobrazená v MolStar (rotace / zoom / úroveň reziduí) | |
| Spolehlivost predikce | Skóre spolehlivosti pro každé reziduum: Výborné (>90) / Dobré (70-90) / Uspokojivé (50-70) / Nízké (<50) | |
| Vazebná místa (GPSite) | Funkční místa predikovaná AI: DNA / RNA / Peptid / Protein / ATP / ZN / CA / MG / MN | |
| Anotace reziduí | Aminokyselina pro každé reziduum + typ místa + skóre spolehlivosti (pokud je k dispozici JSON z GPSite) | |
| Stažení PDB | Stažení celého souboru PDB pro offline analýzu (PyMOL / ChimeraX / Rosetta) |
AI shrnutí
- Nejprve predikujte strukturu — poté vygenerujte krátkou interpretaci výsledku
- Zahrnuje kvalitu pLDDT, funkční indicie vazebných míst a praktický další krok
- Po shrnutí můžete pokládat doplňující otázky k tomuto proteinu
💡 Vyzkoušejte tyto ID genů: (Cucumber) · (Melon) · (Watermelon) · (C. pepo) · (C. moschata)