タンパク質構造
ESMFold 予測 · 信頼度 · 機能的結合部位
タンパク質構造カバー
| 種 | ESMFold PDB | 結合部位アノテーション |
|---|---|---|
| Cucumber | 23,736 | GPSite（23,730 遺伝子） |
| Watermelon | 14,901 | — |
| Melon | 27,757 | GPSite（27,757 遺伝子） |
| Pumpkin (C. moschata) | 29,898 | GPSite（29,898 遺伝子） |
| Pumpkin (C. pepo) | 26,813 | GPSite（26,813 遺伝子） |
| BitterGourd | 39,839 | GPSite（39,839 遺伝子） |
| BottleGourd | 21,629 | GPSite（21,629 遺伝子） |
| WaxGourd | 26,897 | GPSite（26,897 遺伝子） |
| SpongeGourd | 30,846 | GPSite（30,846 遺伝子） |
タンパク質ごとに得られる情報
| 3D構造 | MolStar で描画されたインタラクティブな ESMFold 予測（回転 / 拡大 / 残基レベル） | |
| 予測信頼度 | 残基ごとの信頼度: 優（>90）/ 良（70-90）/ 可（50-70）/ 低（<50） | |
| 結合部位（GPSite） | AI予測の機能部位: DNA / RNA / ペプチド / タンパク質 / ATP / ZN / CA / MG / MN | |
| 残基アノテーション | 残基ごとのアミノ酸 + 部位タイプ + 信頼度（GPSite JSON がある場合） | |
| PDBダウンロード | オフライン解析用の完全なPDBファイル（PyMOL / ChimeraX / Rosetta） |
AI解説
- まず構造を予測 — その後、結果の短い解説を生成
- pLDDT品質、結合部位の機能ヒント、次の一手をカバー
- 要約の後、このタンパク質について追加質問が可能
💡 これらの遺伝子IDを試す： (Cucumber) · (Melon) · (Watermelon) · (C. pepo) · (C. moschata)