Eiwitstructuur
ESMFold-voorspellingen · betrouwbaarheid van de voorspelling · functionele bindingsplaatsen
Dekking van eiwitstructuren
| Soort | ESMFold-PDB's | Annotatie van bindingsplaatsen |
|---|---|---|
| Cucumber | 23,736 | GPSite (23,730 genen) |
| Watermelon | 14,901 | — |
| Melon | 27,757 | GPSite (27,757 genen) |
| Pumpkin (C. moschata) | 29,898 | GPSite (29,898 genen) |
| Pumpkin (C. pepo) | 26,813 | GPSite (26,813 genen) |
| BitterGourd | 39,839 | GPSite (39,839 genen) |
| BottleGourd | 21,629 | GPSite (21,629 genen) |
| WaxGourd | 26,897 | GPSite (26,897 genen) |
| SpongeGourd | 30,846 | GPSite (30,846 genen) |
Wat u per eiwit krijgt
| 3D-structuur | Interactieve ESMFold-voorspelling, weergegeven met MolStar (roteren / zoomen / aminozuurniveau) | |
| Betrouwbaarheid van de voorspelling | Betrouwbaarheidsscore per aminozuur: Uitstekend (>90) / Goed (70-90) / Redelijk (50-70) / Laag (<50) | |
| Bindingsplaatsen (GPSite) | Door AI voorspelde functionele plaatsen: DNA / RNA / Peptide / Protein / ATP / ZN / CA / MG / MN | |
| Aminozuurannotaties | Aminozuur per residu + plaatstype + betrouwbaarheidsscore (wanneer GPSite-JSON beschikbaar is) | |
| PDB-download | Volledig PDB-bestand downloaden voor offline analyse (PyMOL / ChimeraX / Rosetta) |
AI-samenvatting
- Voorspel eerst een structuur — genereer daarna een korte interpretatie van het resultaat
- Behandelt de pLDDT-kwaliteit, functionele aanwijzingen voor bindingsplaatsen en een praktische vervolgstap
- Stel na de samenvatting vervolgvragen over dit eiwit
💡 Probeer deze gen-ID's: (Cucumber) · (Melon) · (Watermelon) · (C. pepo) · (C. moschata)